Occupational history of exposure to zoonotic agents in people dedicated to livestock in San Pedro de los Milagros, Antioquia, Colombia / Antecedentes ocupacionales de la exposición a agentes zoonóticos en personas dedicadas a la ganadería en San Pedro de los Milagros, Antioquia, Colombia

Abstract Introduction: According to the World Health Organization, livestock farming is one of the anthropic activities in which workers are exposed to various zoonotic agents. Objectives: To establish the frequency of seropositivity (IgG antibodies) against some zoonotic agents in people with occupational exposure to livestock in San Pedro de los Milagros (Antioquia), and to analyze associated factors. Materials and methods: Descriptive study carried out on a population of 328 cattle farmers. Demographic data were collected and the seropositivity frequency of IgG antibodies to Babesia bovis, Babesia bigemina, Anaplasma phagocytophilum, Ehrlichia chaffensis, Borrelia burgdorferi, Coxiella burnetii, Francisella tularensis, Brucella abortus, Brucella suis, Leptospira interrogans, and Toxoplasma gondii was determined. Overall and specific prevalence, prevalence ratios and binary logistic regressions were estimated. Results: The highest seropositivity frequencies were 47.6% for T. gondii, 33.5% for B. burgdorferi and 13% for E. chaffensis. The prevalence of T. gondii and B. burgdorferi had statistical association with sex [RP:1.3 (CI:1.0-1.8) and 2.0 (CI:1.1-3.9) respectively], and age group [(RP:1.5 (CI:1.2-1,9) and 2.5 (CI:1.4-6.4) respectively]. In workers with more than 10 years of related work experience, statistical association was 50% [RP:1.5 (CI:1.2-1.9) and 2.5 (CI:1.6-2.3), respectively]. There were no seropositive results for B. abortus, B. suis, B. bovis and B. bigemina. Conclusions: Exposure to some zoonotic agents was evidenced. This is determinant for the knowledge of tropical zoonotic diseases transmitted by vectors in livestock production systems.

Resumen Introducción. Según la Organización Mundial de la Salud, la ganadería es una actividad antrópica profesional en la que los trabajadores se ven expuestos a diversos agentes zoonóticos. Objetivos. Determinar la frecuencia de seropositividad (anticuerpos IgG) frente a algunos agentes zoonóticos en personas con exposición ocupacional a la ganadería en San Pedro de los Milagros (Antioquia) y analizar los factores asociados. Materiales y métodos. Estudio descriptivo realizado en una población de 328 productores ganaderos. Se recolectaron datos demográficos; se determinó la frecuencia de seropositividad de anticuerpos IgG de Babesia bovis, Babesia bigemina, Anaplasma phagocytophilum, Ehrlichia chaffensis, Borrelia burgdorferi, Coxiella burnetii, Francisella tularensis, Brucella abortus, Brucella suis, Leptospira interrogans y Toxoplasma gondii, y se calcularon prevalencias globales y específicas, razones de prevalencia y regresiones logísticas binarias. Resultados. Las frecuencias más altas de seropositividad fueron 47.6% para T. gondii, 33.5% para B. burgdorferi y 13% para E. chaffensis. Las prevalencias de T. gondii y B. burgdorferi presentaron asociación estadística con el sexo (RP: 1.3 (IC: 1.0-1.8) y 2.0 (IC: 1.1-3.9), respectivamente) y el grupo etario (RP:1.5 (IC: 1.2-1.9) y 2.5 (IC: 1.4-6.4) respectivamente). En trabajadores con más de diez años en la labor la asociación estadística fue de 50% (RP:1.5 (IC:1.2-1.9) y 2.5 (IC:1.6-2.3), respectivamente). No hubo resultados de seropositividad para B. abortus, B. suis, B. bovis y B. bigemina. Conclusiones. Se evidenció exposición a algunos agentes zoonóticos, lo que resulta determinante para el conocimiento de las enfermedades zoonóticas tropicales transmitidas por vectores en la ganadería.

Serological evidence of exposure to some zoonotic microorganisms in cattle and humans with occupational exposure to livestock in Antioquia, Colombia / Evidencia serológica de exposición a algunos microorganismos zoonóticos en bovinos y humanos con exposición ocupacional a ganadería en Antioquia, Colombia / Evidências sorológicas de exposição a alguns microrganismos zoonóticos em bovinos e em humanos com exposição ocupacional ao gado na Antióquia, Colômbia

Bacteria belonging to Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia and Coxiella genera are considered emerging pathogens and livestock is one of the contexts where the transmission of these microorganisms can occur. The goal of this study was to determine serological evidence for the exposure to these bacteria in cattle and humans with occupational exposure to livestock in the subregions North and Magdalena Medio, Antioquia, Colombia, and to explore related factors. A cross-sectional study was conducted in 48 livestock farms distributed in six municipalities from both subregions: Belmira, Entrerríos and San Pedro de los Milagros (North), and Puerto Berrío, Puerto Nare and Puerto Triunfo (Magdalena Medio). Blood samples from 332 people and 384 bovines were evaluated by serology (IgM and IgG) screening for bacteria from the Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia, and Coxiella genera. Seropositivity in humans from both regions was 42.4% (95%CI: 31.2-55.1) for Anaplasma, 74.2% (95%CI: 66.0-84.4) for Ehrlichia, 72.5% (95%CI: 62.1-82.0) for Rickettsia, and 60.7% (95%CI: 59.7-69.1) for Coxiella burnetii. In cattle, seropositivity was 31.6% (95%CI: 19.9-44.2), 66.8% (95%CI: 55.2-78.1), 64.6% (95%CI: 53.8-74.5), and 61.6% (95%CI: 51.9-69.2), respectively. History of biting by ticks, milking, vaccination, having dogs and hens in the residence, as well as the consumption of raw milk derivatives were some factors associated with the infection by the bacteria studied. The results suggest a previous and recent exposure to these zoonotic bacteria genera in people with occupational exposure to livestock, as well as in cattle in the two studied subregions.

Las bacterias pertenecientes a los géneros Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia y Coxiella son consideradas patógenos emergentes y la ganadería es uno de los contextos donde se puede producir la transmisión de este tipo de microorganismos. El objetivo de este estudio fue determinar la evidencia serológica, debida a la exposición a estas bacterias en bovinos y humanos con exposición ocupacional a ganadería en las subregiones Norte y Magdalena Medio, Antioquia, Colombia, además de estudiar los factores relacionados. Se realizó un estudio transversal en 48 fincas ganaderas, distribuidas en seis municipios de ambas subregiones: Belmira, Entrerríos y San Pedro de los Milagros (Norte), y Puerto Berrío, Puerto Nare y Puerto Triunfo (Magdalena Medio). Las muestras de sangre de 332 personas y 384 bovinos fueron evaluadas mediante tamización serológica (IgM e IgG) para la detección de bacterias de los géneros Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia, y Coxiella. La seropositividad en humanos de ambas regiones fue 42,4% (IC95%: 31,2-55,1) en el caso de Anaplasma, un 74,2% (IC95%: 66,0-84,4) en Ehrlichia, un 72,5% (IC95%: 62,1-82,0) en Rickettsia, y un 60,7% (IC95%: 59,7-69,1) en Coxiella burnetii. En los bovinos, la seropositividad fue 31,6% (IC95%: 19,9-44,2), 66,8% (IC95%: 55,2-78,1), 64,6% (IC95%: 53,8-74,5), y 61,6% (IC95%: 51,9-69,2), respectivamente. El antecedente de haber sido mordido por garrapatas, ordeñar, vacunación, tener perros y gallinas en la residencia, así como el consumo de derivados de leche cruda fueron algunos de los factores asociados con la infección por las bacterias estudiadas. Los resultados sugieren la exposición previa y reciente a estas bacterias en personas con una exposición ocupacional a la ganadería, así como a los bovinos en las dos subregiones estudiadas.

As bactérias dos gêneros Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia e Coxiella são considerados patógenos emergentes, e a transmissão desses microrganismos pode ocorrer no contexto da pecuária. O estudo teve como objetivos determinar as evidências sorológicas de exposição a essas bactérias em bovinos e em humanos com exposição ocupacional ao gado nas sub-regiões Norte e Magdalena Médio, Antióquia, Colômbia, e explorar fatores associados. Foi realizado um estudo transversal em 48 fazendas de gado bovino distribuídas em seis municípios nas duas sub-regiões: Belmira, Entrerríos e San Pedro de los Milagros (Norte) e Puerto Berrío, Puerto Nare e Puerto Triunfo (Magdalena Médio). Amostras de sangue de 332 humanos e 384 bovinos foram analisadas com sorologia (IgM e IgG) para bactérias dos gêneros Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia e Coxiella. Os níveis de sorologia positiva em humanos das duas regiões foram de 42,4% (IC95%: 31,2-55,1) para Anaplasma, 74,2% (IC95%: 66,0-84,4) para Ehrlichia, 72,5% (IC95%: 62,1-82,0) para Rickettsia e 60,7% (IC95%: 59,7-69,1) para Coxiella burnetii. Nos bovinos, os níveis foram 31,6% (IC95%: 19,9-44,2), 66,8% (IC95%: 55,2-78,1), 64,6% (IC95%: 53,8-74,5) e 61,6% (IC95%: 51,9-69,2), respectivamente. Os fatores associados às bactérias estudadas foram: história de picada de carrapato, ordenha, vacinação, presença de cães e galinhas no domicílio e consumo de laticínios feitos com leite cru, entre outros. Os resultados sugerem exposição prévia e recente a esses gêneros bacterianos zoonóticos em pessoas com contato ocupacional com gado, assim como nos próprios animais, nas duas sub-regiões estudadas.

Seguridad alimentaria en poblaciones indígenas y campesinas: una revisión sistemática / Food security in indigenous and peasant populations: a systematic review

Resumen La seguridad alimentaria y su vulnerabilidad en poblaciones indígenas y campesinas, se ha convertido en un tema de interés para la salud pública alrededor de todo el mundo, en asuntos como medición, clasificación y factores que la determinan. Esta revisión sistemática tiene como propósito describir la situación de la seguridad alimentaria en comunidades indígenas y campesinas, y los métodos empleados para su evaluación. La búsqueda de la literatura se realizó en las bases de datos PubMed (5), ScienceDirect (221) y Scopus (377), buscando publicaciones entre los años 2004 y 2015, con un total de 603 artículos arrojados por las rutas de búsqueda. Al final del proceso de tamización y sumados los artículos encontrados en la literatura gris se obtuvieron 25 artículos para escribir la revisión. En los 11 años evaluados, entre el 2004 y el 2015, la actividad científica alrededor del tema fue escasa con apenas un 4,54% de las publicaciones en este tema, pero para el año 2011 el porcentaje de publicaciones aumentó hasta un 13,63%. Se encontraron diversos factores que tienen influencia en el desarrollo de la inseguridad alimentaria, entre ellos está el cambio climático, la diversidad de la agricultura y la globalización y occidentalización del mercado.

Abstract Food security and the vulnerability among indigenous and peasant populations has become a topic of interest to public health all around the world, leading to the investigation about measurement, classification and factors that determine it. This systematic review aims to describe the situation of food security in indigenous and peasant communities, and the methods used for evaluation. The literature search was performed on the Pub Med (5), ScienceDirect (221) and Scopus (377) databases searching for publications between 2004 and 2015, a total of 603 items were located with the search engines. At the end of the screening process and after adding the items found in the gray literature, 25 papers were obtained to write the review. In the 11 years evaluated between 2004 and 2015, scientific activity around the theme was poor with just 4.54% of the publications on this subject, but for 2011 the percentage increased to 13 publications, 63%. Various factors that influence the development of food insecurity are climate change, the diversity of agriculture, globalization and market westernization.

Procedure optimization for concentration and detection of protozoa and helminths in great volumes of water / Optimización del procedimiento para la concentración y detección de protozoos y helmintos en grandes volúmenes de agua

Feces-contaminated water is a vehicle of transmission of potentially pathogenic microorganisms responsible for illnesses that represent main causes of death worldwide. A protocol for detection of intestinal parasites in great volumes of water was optimized. It includes: membrane filtration, mechanical agitation with detergent, centrifugation, chemical concentration with Mini Parasep® and microscopic examination. From samples of feces-contaminated water containing parasitic forms, a total recovery percentage of 85.7 percent of parasites was achieved after tests. This procedure provides a useful alternative method that could be subjected to validation as a routine methodology in the diagnosis of microbiological water quality(AU)

El agua contaminada con heces es un vehículo de transmisión de microorganismos potencialmente patógenos causantes de enfermedades que constituyen causas principales de muerte a nivel mundial. Se optimizó un protocolo para la detección de parásitos intestinales en grandes volúmenes de agua. Este incluye: filtración por membrana, agitación mecánica con detergente, centrifugación, concentración química con Mini Parasep® y examen microscópico.En muestras de agua contaminada con heces que contenían formas parasitarias, se obtuvo un porcentaje de recuperación total del 85.7 por ciento de estas formas después de aplicar el protocolo. El procedimiento constituye un método alternativo que podría someterse a validación como metodología habitual para el diagnóstico de la calidad microbiológica del agua(AU)

Patógenos e indicadores microbiológicos de calidad del agua para consumo humano / Pathogens and Microbiological Indicators of the Quality of Water for Human Consumption / Patógenos e Indicadores Microbiológicos da qualidade da água pro consumo humano

Resumen Las mejoras en el suministro de agua son oportunidades para solucionar problemas de salud pública. De ahí la importancia de establecer modelos de evaluación y gestión integral que garanticen su calidad. Actualmente hay múltiples metodologías para detectar la contaminación microbiana en el agua. Sin embargo, los elevados costos que representan, los tiempos de análisis y aislamiento en cultivo de microorganismos han sido obstáculo para establecer la calidad microbiana del agua para consumo humano. El uso de microorganismos bioindicadores de calidad del agua disminuye los costos y facilita la implementación de medidas eficientes de tratamiento, control del agua y de enfermedades asociadas a su transmisión. El objetivo de la revisión fue describir los principales indicadores microbiológicos empleados para la evaluación del agua potable, como elementos clave para proponer un nuevo esquema de monitoreo en Colombia. Los resultados reflejan considerar como bioindicadores, además de las bacterias y protozoos ya establecidos en la norma, algunos agentes microbianos no considerados, como virus u otras bacterias y parásitos. Por otro lado, indican la necesidad de establecer valores de referencia y definir los microorganismos a emplear con base en evaluaciones específicas de la situación microbiana del agua en monitoreos de validación, operación y verificación. Esta revisión aporta información importante para la actualización de la norma colombiana con base en el conocimiento de estándares internacionales, nacionales y locales.

Abstract Upgrading water supplies is an opportunity to resolve health care problems. Thus, this shows the importance of establishing comprehensive evaluation and management models to guarantee quality. Currently, there are numerous methodologies to detect microbial water contamination. Nevertheless, the high cost, which analysis time and isolation in microorganism cultures represent, has been an obstacle to establish microbial water quality for human consumption. The use of microorganisms that are bio indicators of water quality decreases costs and facilitates the implementation of efficient treatment measures, water control and control of diseases associated to transmission. The objective of the review was to describe the main microbiological indicators used to evaluate drinking water as key items to propose a new monitoring schema in Colombia. Results reflect the need to consider some microbial agents that were previously not considered like viruses and other bacteria and parasites, bio indicators, in addition to bacteria and protozoans already established in the norm. On the other hand, they indicate the need to establish reference values and define the microorganisms, which will be used based on specific evaluations of the microbial situation of the water in monitoring to validate, operate and verify. This review contributes important information to update Colombian norms based on knowledge of international, national and local standards.

Resumo As melhoras na provisão da água são chances para solucionar dificuldades na saúde pública. Daí o relevo de estabelecer modelos de avaliação e gestão integral que garantissem a sua qualidade. Atualmente ha múltiplas metodologias para detecção da contaminação microbiana na água. Contudo os elevados custos que representam, os tempos de análises e isolamento em cultivo dos microrganismos tem sido barragem para estabelecer a qualidade microbiana da água para ingesta humana. Ser utente dos micro-organismos bio indicadores da qualidade da água diminui os custos e ameniza a implementação de medidas eficientes de tratamento, controle da água e das doenças associadas a sua transmissão. O propósito da revisão foi descrever os mais relevantes indicadores microbiológicos empregados pra avaliação da água potável, como elementos chave para propor um novo esquema de monitoramento na Colômbia. Os resultados espelham considerar como bio indicadores, além das bactérias e os protozoários já estabelecidos na norma, alguns agentes microbianos não considerados, como vírus ou outras bactérias e parasitos. Por um outro lado, assinalam a necessidade de estabelecer valores de referencia e definir os microrganismos dos quais serão utentes com base nas avaliações específicas da situação microbiana da água nos monitoramentos de validação, operação e verificação. Esta revisão verba informação a relevar pra atualização da normatividade colombiana baseada no conhecimento dos padrões internacionais, nacionais e locais.

Estandarización de una reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (qPCR) para la detección de strongyloides stercoralis en muestras de materia fecal / Standardization of a real-time polymerase chain reaction (qPCR) for the detection of strongyloides stercoralis in stool samples

Introducción: el diagnóstico de estrongiloidiasis se realiza de rutina en los laboratoriosclínicos; sin embargo, su detección se dificulta debido a la baja excreción parasitaria y la baja sensibilidad de las pruebas parasitológicas empleadas. Objetivo:diseñar y estandarizar una PCR en tiempo real (qPCR) para la detección de ADN de Strongyloides stercoralis en muestras de materia fecal. Materiales y métodos: se establecieron las condiciones de qPCR y se evaluaron: a) la especificidadanalítica mediante análisis BLASTn de secuencias obtenidas de muestras positivas para Strongyloides stercoralis, b) sensibilidad analítica mediante dilucionesseriadas de muestras que contenían larvas de Strongyloides stercoralis y c) la ocurrencia de reacciones cruzadas con otros parásitos e inhibidores de la amplificación. Resultados: se amplificó un fragmento de 101 pb del gen 18S del ARN ribosomal. El valor de Ct osciló entre 23 y 29, tomando un Ct ≤35 como el punto de corte para muestras positivas. El análisis BLASTn de las secuencias obtenidas mostró un porcentaje de identidad del 98% con secuencias 18S del ARN ribosomal de Strongyloides stercoralis reportadas en la NCBI. El límite inferiorde detección de la qPCR fue 0,9 ng/μL. No se evidenció reacción cruzada con Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura, Uncinarias, Hymenolepis nana, Entamoeba histolytica/Entamoeba dispar, Entamoeba hartmanni, Giardia intestinalis e Iodamoeba bütschlii. No se detectaron inhibidores en las muestras de materia fecal. Conclusiones: la sensibilidad y la especificidad analítica de la qPCR comparado con el examen directo de heces son del 100%; sin embargo, aún no es posible interpretar su utilidad clínica.

Introduction: the diagnosis of strongyloidiasis is performing routinely in clinical laboratories; however, its detection is difficult due to low parasitic excretion and low sensitivity of the parasitological tests employed. Objective: to design and standardize a real-time PCR (qPCR) for the detection of Strongyloides stercoralis DNA in stool samples. Materials and methods: qPCR conditions were established and it were assessed: a) analytical specificity by BLASTn analysis of sequences obtained from samples positive for Strongyloides stercoralis, b) analytical sensitivity by serial dilutions of samples containing Strongyloides stercoralislarvae and c) the occurrence of cross-reactions with other parasites and amplification inhibitors. Results: a 101 bp fragment of the 18S ribosomal RNA gene was amplified. The value of Ct ranged from 23 and 29, with a Ct value ≤35 as a cut-off point for positive samples. BLASTn analysis of the obtained sequences showed an identity percentage of 98% with 18S ribosomal RNA sequences of Strongyloides stercoralis reported in the NCBI. The qPCR lower limit of detection was 0.9 ng/ μL. There was no cross-reaction with Ascaris lumbricoides, Trichuristrichiura, Uncinarias, Hymenolepis nana, Entamoeba histolytica/Entamoeba dispar, Entamoeba hartmanni, Giardia intestinalis, and Iodamoeba bütschlii. No inhibitors were detected in the stool samples. Conclusion: the sensitivity and analytical specificity of qPCR compared to direct examination of feces are 100%; however, it is still not possible to interpret their clinical utility.

Determinación de anticuerpos totales (IgG/IgM) y específicos (IgM) para el virus de la hepatitis E y detección molecular del virus en heces de humanos con o sin exposición ocupacional a porcinos en 10 municipios de Antioquia / Determination of total (IgG/IgM) and specific (IgM) antibodies to Hepatitis E Virus and molecular detection of the virus in feces of humans with or without occupational exposure to pigs in 10 municipalities of Antioquia, Colombia / Determinação de anticorpos totais (IgG/IgM) e específicos (IgM) para o vírus da hepatite E e detecção molecular do vírus em fezes de humanos com ou sem exposição ocupacional a porcinos em 10 municípios de Antioquia

En 10 municipios de Antioquia se determinó la seropositividad para anticuerpos totales (IgG/ IgM) y específicos (IgM) para el virus de la hepatitis E (VHE), y se buscó identificar el RNA del virus en heces de personas positivas para IgM. Se evaluaron dos grupos: uno de individuos expuestos a cerdos y otro sin dicha exposición, este último dividido en dos subgrupos (convivientes de expuestos y población general). La frecuencia de anticuerpos totales en los expuestos fue del 15,7% y la de IgM, del 2,5% (p < 0,001). En el grupo sin exposición ocupacional pero convivientes de expuestos, los anticuerpos totales se hallaron en el 5,9% y no se detectó IgM. En el subgrupo de población general la seropositividad fue del 7,2% para IgG/IgM y del 0,81% para IgM (p < 0,001). En ninguna de las muestras de heces de individuos positivos para IgM se halló el RNA del VHE. Los resultados muestran que los individuos expuestos ocupacionalmente a cerdos tienen mayor riesgo (RP: 2,42) de presentar anticuerpos anti-VHE que aquellos sin dicha exposición (CI95%: 1,66-3,53) (p < 0,001). También indican que en Antioquia el VHE circula en personas con y sin exposición a cerdos. Se requieren más estudios sobre el VHE en Colombia.

Em 10 municípios de Antioquia se determinou a seropositividade para anticorpos totais (IgG/IgM) e específicos (IgM) para o vírus da hepatite E (VHE), e se procurou identificar o RNA do vírus em fezes de pessoas positivas para IgM. Avaliaram-se dois grupos: um de indivíduos expostos a porcos e outro sem dita exposição, este último dividido em dois subgrupos (conviventes de expostos e população geral). A frequência de anticorpos totais nos expostos foi de 15,7% e a de IgM, do 2,5% (p < 0,001). No grupo sem exposição ocupacional, mas conviventes de expostos, os anticorpos totais se acharam em 5,9% e não se detectou IgM. No subgrupo de população geral a seropositividade foi de 7,2% para IgG/IgM e de 0,81% para IgM (p < 0,001). Em nenhuma das mostras de fezes de indivíduos positivos para IgM se achou o RNA do VHE. Os resultados mostram que os indivíduos expostos ocupacionalmente a porcos têm maior risco (RP: 2,42) de apresentar anticorpos anti-VHE que aqueles sem dita exposição (CI95%: 1,66-3,53) (p < 0,001). Também indicam que em Antioquia o VHE circula em pessoas com e sem exposição a porcos. Requerem-se mais estudos sobre o VHE na Colômbia.

Serological and molecular detection of Hepatitis E virus in pig farms of Antioquia / Detección serológica y molecular del virus de la Hepatitis E en cerdos de granjas antioqueñas / Detecção serológica e molecular do vírus da hepatite E em suínos no departamento de Antioquia, Colômbia

Hepatitis E virus (HEV) is the viral agent that produces most cases of acute hepatitis worldwide. Four genotypes and 24 subtypes of HEV have been identified. Presence of viral strains in pigs suggests this species is a reservoir for HEV. A case of Hepatitis E in humans has been reported in Antioquia, the largest pig producer and pork consumer province in Colombia. This study investigated the presence of HEV in pigs from several swine farms in Antioquia by looking for anti-HEV antibodies and viral RNA in pig feces. Serological tests were performed for detecting IgG and IgM anti-HEV. Molecular assays (RT-PCR) were also used for detecting the ORF-1 marker of HEV viral genome. These procedures were performed on 210 animals from 30 pig farms. Presence of antibodies and molecular analysis were organized by frequencies and analyzed using the R software (version 2.15.2). 100% of the samples were positive for IgG antibodies, while 57% of the samples were positive for IgM antibodies. According to the molecular analysis, 26% of pig feces had genetic material from HEV. This study demonstrates exposure and circulation of HEV in pig farms of Antioquia.

La Hepatitis E es una enfermedad producida por el Virus de Hepatitis E (HEV), considerado el agente vírico con mayor producción de hepatitis agudas alrededor del mundo. Se han determinado 4 genotipos y 24 subtipos de HEV. La presencia de cepas virales tanto en humanos como en otras especies, ha sugerido que existen reservorios animales para HEV, entre los cuales el cerdo juega un papel importante. En Antioquia se ha reportado un caso de Hepatitis E en humanos. Teniendo en cuenta que este departamento es el principal productor y consumidor de cerdos en Colombia, se investigó la presencia de este virus en los cerdos de diferentes granjas porcícolas, con el fin de determinar anticuerpos anti-HEV y RNA viral en heces porcinas. Para lograr esto, se realizaron pruebas serológicas para la detección de anticuerpos IgG e IgM anti-HEV, y pruebas moleculares (RT-PCR) para la detección del marcador ORF-1 del genoma viral de HEV. Estos procedimientos se realizaron en 210 animales de 30 granjas porcícolas de Antioquia. La presencia de anticuerpos y análisis moleculares en los cerdos, se determinaron por frecuencias y se analizaron mediante el software R versión 2.15.2. El 100% de las muestras fueron positivas para anticuerpos IgG; mientras que para anticuerpos IgM, los positivos representaron el 57% de las muestras evaluadas. El análisis molecular determinó que el 26% de los cerdos presentó material genético de HEV en sus heces. Esta información demuestra la exposición y la circulación de HEV en cerdos de las granjas evaluadas en municipios de Antioquia.

A hepatite E é uma doença produzida pelo vírus da hepatite E (HEV), considerado o agente virulento com maior produção de hepatites agudas ao redor do mundo. Tem se determinado quatro genótipos e 24 subtipos de HEV. A presença de cepas virais tanto em humanos quanto em outras espécies, tem sugerido que existem reservatórios animais para HEV, entre os quais o suíno tem grande importância. Em Antioquia tem se reportado um caso de hepatite E em humanos. Tendo de presente que este departamento é o principal produtor e consumidor de suínos na Colômbia, pesquisou-se a presença deste vírus em suínos de diferentes granjas suínas, com o fim de determinar anticorpos anti-HEV e RNA viral em fezes porcinas. Para lograr isto, realizaram-se testes serológicos para a detecção de anticorpos IgG e IgM anti-HEV e testes moleculares (RT-PCR) para a detecção do marcador ORF-1 do genoma viral de HEV. Estes procedimentos realizaram-se em 210 animais de 30 granjas suínas em Antioquia. A presença de anticorpos e as análises moleculares nos suínos, determinaram-se por frequências e se analisaram mediante o software R Versão 2.15.2. O 100% das amostras foram positivas para anticorpos IgG; enquanto que para anticorpos IgM os positivos representaram o 57% das amostras avaliadas. O analise molecular determinou que o 26% dos suínos apresentou material genético de HEV em suas fezes. Esta informação demonstra a exposição e circulação de HEV em suínos das granjas avaliadas em municípios de Antioquia, Colômbia.

Assessing bovine babesiosis in Rhipicephalus (Boophilus) microplus ticks and 3 to 9-month-old cattle in the middle Magdalena region, Colombia

Babesia sp. is a protozoan hemoparasite that affects livestock worldwide. The Colombian Middle Magdalena is an enzootic region for babesiosis, but there is no previous research providing detail on its transmission cycle. This study aims to assess some Babesia sp. infection indicators in cattle and ticks from the area, by using direct microscopic and molecular techniques to detect the infection. In the cattle, 59.9% and 3.4 % positivity values for B. bigemina and mixed infection (B. bovis + B. bigemina) were found respectively. In ticks, the positivity of B. bigemina reached 79.2% and 9.4% for the mixed infection. The degree of infestation in the region was 3.2 ticks per bovine. There was positive correlation between tick control acaricide frequencies and infestation in bovines. This leads us to infer that control periodicity greater than 90 days, in stable zones, is an abiotic factor that benefits the acquisition of protective immunity in calves, the natural control of the infection and eventual disease absence. It is necessary to monitor the disease by applying new entomological and parasitological indicators showing the complexity of this phenomenon.

Role of rumen ciliated protozoa in the synthesis of conjugated linoleic acid: A review / Papel de los protozoos ciliados ruminales en la síntesis de ácido linoleico conjugado: Revisión / Papel dos protozoários ciliados no rúmem para a síntese de ácido linoléico conjugado: Uma Revisão

Traditionally, ruminal ciliate protozoa have been studied with respect to the metabolism of dietary nutrients. Their role has focused on their predatory behavior, the paradigm of its retention in the rumen, and its apparent limited flow to the duodenum. On the other hand, Conjugated Linoleic Acid (CLA) and Vaccenic Acid (VA) are important because of their nutritional value. This review aims to characterize the biological alternatives used by rumen ciliate protozoa for the production of CLA, highlighting three aspects: 1) rumen protozoa are involved only in the initial stage of biohydrogenation to produce CLA isomers, 2) desaturation by protozoa has not been reported, while endogen synthesis by desaturation of VA in mammary glands and fatty tissues has been demonstrated as the main route of CLA in ruminants, 3) even though incorporation of VA and cis9, trans11-CLA in protozoa structure is related with CLA production, this is only important when protozoa flow from rumen to duodenum, producing 30 to 43% of CLA and a 40% of VA, respectively. It is concluded that rumen protozoa are fundamental in the lipid metabolism of ruminants.

Tradicionalmente, los protozoos ciliados ruminales han sido estudiados en relación con el metabolismo de nutrientes de la dieta suministrada al rumiante. Particularmente, su papel ha sido cuestionado debido a sus características predadoras, aunado al paradigma de la retención de los protozoos en el rumen y el aparente limitado flujo al duodeno por reciclaje de la proteína microbiana. De otro lado, los ácidos linoleico conjugado (CLA) y vacénico (VA) son dos productos de gran interés nutricional. Estas dos situaciones han generado interés en la investigación de esta representativa población de la microbiota ruminal. El objetivo de este trabajo fue caracterizar, a partir de la literatura científica, las alternativas biológicas utilizadas por los protozoos ciliados del rumen para la producción de CLA. Nosotros encontramos que: 1) los protozoos ruminales sólo participan en la parte inicial de la biohidrogenación, la “isomerización de ácidos grasos insaturados”, generando isómeros de CLA, 2) la desaturación en protozoos, no se demostró en estudios, y queda claro que la síntesis endógena por desaturación de VA, en glándula mamaria y tejidos grasos se establece como el mayor recurso de CLA en el rumiante, 3) aun cuando la incorporación de VA y cis9, trans11-CLA en la estructura de los protozoos está relacionada con la producción de CLA, esta sólo es importante hasta cuando se da el flujo de protozoos del rumen a duodeno donde son responsables del 30 al 43% del CLA y 40% del VA. Se concluye, que los protozoos ruminales son trascendentales en el metabolismo lipídico de rumiantes.

Tradicionalmente, os protozoários ciliados no rúmen têm sido estudados em relação ao metabolismo dos nutrientes na dieta fornecida ao ruminante. Em particular, o seu papel tem sido questionado devido às suas características predatórias, combinado com o paradigma da retenção de protozoários no rúmem e ao aparente fluxo limitado para o duodeno através da reciclagem da proteína microbiana. Por outro lado, o ácido linoléico conjugado (CLA) e o vacenico (VA) são dois produtos de grande interesse nutricional. Estas duas situações têm gerado interesse na investigação dessa representativa população da microbiota ruminal. O objetivo deste estudo foi caracterizar as alternativas biológicas utilizadas pelos protozoários ciliados do rúmem para a produção de CLA a partir da literatura científica. Nós encontramos que: 1) os protozoários ruminais só participam na parte inicial da biohidrogenação: a isomerização “de ácidos graxos insaturados”, gerando isômeros do CLA. 2) até hoje, não tem sido demonstrado a desaturação em protozoários e fica claro que a síntese endógena por desaturação do VA na glândula mamária e tecido adiposo se estabelece como a maior fonte de CLA no ruminante. 3) embora a incorporação de VA e cis9, trans11-CLA na estrutura do protozoário está relacionada com a produção de CLA, ésta só é importante ate quando há fluxo de protozoários do rúmem para o duodeno onde são responsáveis do 30 ate 43% do CLA e 40% do VA. A conclusão é que os protozoários ruminais são transcendentais no metabolismo lipídico dos ruminantes.

Comparación de los métodos de preservación de especímenes Anopheles (Diptera: Culicidae) para la extracción de ADN / Comparison of preservation methods of Anopheles (Diptera: Culicidae) specimens for DNA extraction

Resumen Objetivos: Evaluar diferentes tratamientos de preservación de especímenes Anopheles albimanus para conocer su utilidad para conservar la cantidad y calidad del ADN que permita su análisis en estudios moleculares posteriores. Materiales y métodos: Se realizó un estudio comparativo experimental con tres bloques de tratamientos de preservación: sílica gel, etanol y congelación; los dos últimos bloques se dividieron en dos niveles cada uno: etanol absoluto, etanol al 70% y congelación a -20°C, congelación a -80°C respectivamente. El bloque control estuvo conformado por especímenes frescos sin tratamiento de preservación. Se extrajo el ADN de cada espécimen, se cuantificó por espectrofotometría y se amplifico el espaciador interno transcrito 2 (ITS2) mediante PCR. Se realizó un análisis comparativo entre bloques de tratamiento usando la frecuencia de amplificación de ITS2. Resultados: Se obtuvo la amplificación de ITS2 de todos los especímenes sin preservación previa, del 60% de los preservados en sílica gel y del 20% de los preservados en congelación a -80°C y en etanol al 70%. Se halló diferencia estadísticamente significativa (p<0,05) entre las proporciones de amplificación observadas. No se obtuvo amplificación de los especímenes preservados en congelación a -20°C y no se observó una correlación por regresión logística (p>0,05) entre el índice DO260/DO280 y la concentración de ADN de los especímenes que presentaron amplificación de ITS2. Conclusiones: Los datos sugieren que la conservación en sílica gel o la congelación que se vayan a -80°C pueden ser las mejores condiciones para la preservación de especímenes Anopheles a utilizar en estudios moleculares posteriores.

Abstract Introduction: Various methodologies have been reported for long term specimen preservation, which protect the DNA from degradation allowing its posterior analysis in molecular studies. However, the effectiveness of the preservation methods may vary among insect groups; therefore, it is convenient to determine the preservation method to be used with a particular group before performing molecular studies with a large number of specimens. Objetives: An experimental comparative study was conducted to evaluate different preservation treatments for Anopheles albimanus, to know their utility in conserving the quantity and quality of DNA to be used in subsequent molecular studies. Methods: DNA was extracted from each specimen, it was then quantified by spectrophotometer and the Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) was amplified by PCR. Results: ITS2 amplification was obtained in all specimens without previous preservation, in 60% of those preserved in sílica gel and in 20% of those preserved at -80°C and in 70% ethanol. A significant difference (p<0.05) was found between amplification proportions. Amplification was not obtained in specimens preserved frozen at -20°C and not correlation by logistic regression was observed between the DO260/DO280 index and DNA concentration of specimens presenting ITS2 amplification. Conclusions: The data suggest that keeping specimens in silica gel or frozen at -80°C may be the best conditions to preserve Anopheles specimens for subsequent molecular studies.